涡阳历史悠久，涡阳汉为城父（今谯城区城父镇）、至县地，北魏、北齐曾置涡阳、丹城、龙山县。隋改置肥水县。

清同治三年（1864），由亳州、宿州、阜阳、蒙城析置涡阳县，因袭北魏涡阳县名而命名。《水经注》：涡水“又东南迳涡阳城北”。可见涡阳在设县之初即在涡水之南。应名涡阴，取名“涡阳”名实不符。

1979年3月，划雪涡、涡阳、涡亳合并为涡阳县．

1979年，撤销地区革委会，恢复阜阳行政公署，辖涡阳县。

2000年5月国务院批准新的地级亳州市成立，涡阳县重新回归亳州管辖

涡阳贤哲辈出，文化底蕴深厚。是春秋时期伟大的哲学家、思想家老子的诞生地、道家思想文化的发源地。历史文化名人老子、尹喜、张良、嵇康、陈抟、张乐行等，在这里创造了不朽的历史文化。当代风云人物刘少奇、彭雪枫、张爱萍、张震等，曾先后在这里英勇抗日。境内旅游资源丰富，有老子故里太清官、嵇康墓、陈传卧迹、范蠡冢、捻军会盟旧址、张乐行故居、新四军第四师司令部旧址和辉山烈士陵园等景点。